Il mondo sta lentamente morendo... In un futuro post-apocalittico dove gli umani vivono in grandi città a cupola circondate da terre desolate, si crede che i lupi si siano estinti da 200 anni. Ma alcuni lupi sono ancora rimasti. Questi lupi vivono travestendosi da umani per sopravvivere. Wolf's Rain è la storia di quattro lupi, Kiba, Tsume, Hige e Toboe, che seguiranno il profumo del fiore lunare in una ricerca per trovare il paradiso.