La storia si svolge in un mondo dove la guerra dell'umanità contro l'"ignoto", il nemico dell'umanità, continua. Bambini evacuati in una struttura di ibernazione durante l'invasione dell'"ignoto" decenni fa si risvegliano dal loro sonno e scoprono che i loro corpi hanno sviluppato delle forze soprannaturali. Per proteggere il paese dall'"ignoto" che emerge dal cancello della baia di Tokyo, ragazzi e ragazze combattono per difendere le città di Tokyo, Kanagawa e Chiba.