Un anno dopo che Ozzy e Drix hanno sconfitto Thrax e salvato Frank dalla morte in Osmosis Jones, Ozzy e Drix inseguono un batterio della scarlattina (probabilmente grazie al ritorno di Frank alle sue cattive abitudini alimentari). Durante l'inseguimento, Ozzy, Drix e il germe vengono risucchiati da Frank da una zanzara e arrivano su un adolescente cubano-americano di nome Hector Cruz. Dopo alcuni problemi iniziali con la loro nuova casa, entrambi vengono ingaggiati come investigatori privati, giurando di proteggere il benessere di Hector da qualsiasi minaccia virale, senza contare che lo aiuteranno ad affrontare i cambiamenti della sua adolescenza.