In un mondo del prossimo futuro, dopo l'ultima grande guerra, la maggior parte dell'umanità vive in una manciata di città-stato. Lì, per l'élite privilegiata, la vita dovrebbe essere perfetta. Ma per il giovane Shion, l'unica cosa perfetta è l'incubo in cui la sua vita si è trasformata da quando ha permesso a uno strano ragazzo di nome Nezumi di passare la notte nel suo appartamento. Bandito ai margini della città e privato di ogni privilegio per aver aiutato il misterioso sconosciuto, da allora scomparso, Shion ora si trova in un pericolo ancora peggiore: la sua indagine su una nuova serie di morti misteriose lo porta all'arresto con l'accusa di omicidio! Ma mentre Shion viene inviato all'Istituto Correzionale della città, il tanto atteso Nezumi riappare per salvarlo! Ora in fuga, i due giovani hanno una sola possibilità di sopravvivenza: svelare i misteriosi segreti che si celano nel sinistro cuore di No. 6!