Fallen segue la storia di Luce, una giovane donna mandata in una struttura di riabilitazione simile a una setta, chiamata Sword & Cross, per scontare una pena per un crimine che non ricorda di aver commesso. Tra gli altri residenti, incontra l'enigmatico Daniel e l'esasperante ma irresistibile Cam, tutti sotto l'occhio vigile del sinistro dottor Howson e delle devote sorelle gemelle Miriam e Sophia. Luce dovrà dipanare il mistero di chi è e perché ha un legame con Daniel che risale ben prima del loro tempo nell'istituto.