Il santuario Ukishima si trova in una pittoresca cittadina antica ai margini di un lago. Saya Kisaragi, una giovane sacerdotessa del tempio, vive lì con suo padre, Tadayoshi. Durante il giorno, conduce la vita di una normale studentessa liceale all'accademia Sanbar. Ma di notte, dà la caccia agli "Antichi", creature dotate di capacità fisiche soprannaturali che predano gli esseri umani e che solo lei ha la capacità di sconfiggere.