"Buatlah ziarah untuk masa lalu bersamaku." Kata-kata ini, bersama dengan melodi menghantui dari masa lalunya, menarik pembunuh profesional Mireille Bouquet untuk menjalin kemitraan dengan siswi Jepang Kirika Yumura, seorang amnesia yang memiliki keterampilan membunuh instingtif yang sebanding dengan kemampuan Mireille. Dikejar oleh musuh yang tak henti-hentinya dan waspada, Kirika dan Mireille membentuk kemitraan dengan kode nama Noir, dan memulai pencarian untuk mengungkap kebenaran masa lalu mereka, kebenaran yang bisa berujung pada kematian mereka.