Presiden OSIS yang cantik dan tak tertandingi, Medaka Kurokami, memecahkan semua masalah! Medaka Kurokami, yang baru saja menjadi presiden OSIS ke-98 di Sandbox Academy, memasang kotak saran seperti yang dijanjikan dalam kampanye pemilihannya. "Mimpi kalian adalah milik kalian. Kejar dan wujudkan sendiri. Namun, kekhawatiran kalian adalah milikku. Kirimkan semuanya padaku!!" Saat Medaka memecahkan masalah teman-teman sekelasnya bersama sahabat masa kecilnya, Zenkichi Hitoyoshi, kotak sarannya, yang dijuluki Medaka Box, mendapatkan popularitas besar di kalangan siswa.