Yanagi Yukito adalah seorang yatim piatu yang suatu hari bertemu dengan seorang murid eksentrik dari ayahnya. Pria aneh itu membawanya ke tempat kelahirannya di Ayakashima, yang terdiri dari tujuh pulau di mana makhluk misterius yang disebut "Mitama" dan naga dikabarkan tinggal. Di sana, Yukito bertemu dengan dua murid ayahnya yang lain, yang melindungi keharmonisan Ayakashima... yang segera terancam runtuh.