L'histoire de Hunter × Hunter se concentre sur un jeune garçon nommé Gon Freecss, qui découvre un jour que le père qu'on lui avait toujours dit mort est en réalité vivant et en bonne santé. Il apprend que son père, Ging Freecss, est un Chasseur légendaire, une personne qui a prouvé par examen qu'elle est un membre d'élite de l'humanité, avec une licence pour aller partout ou faire n'importe quoi. Malgré le fait que son père ait abandonné Gon chez ses proches pour poursuivre ses rêves, Gon est déterminé à suivre les traces de son père, à passer l'examen de Chasseur et finalement à retrouver son père, pour se prouver en tant que Chasseur à part entière.