Spider-Man continúa donde lo dejó la exitosa película de acción real del mismo nombre. La serie sigue las aventuras del superhéroe Peter Parker y sus amigos, Harry Osborne y Mary Jane Watson, durante su primer año de universidad en la Empire State University. Parker debe compaginar sus estudios, un trabajo como diseñador web/fotógrafo para el Daily Bugle y una relación intermitente con el amor de su vida, todo mientras lucha para proteger al mundo de supervillanos.