Muppet Babies narra las hilarantes travesuras en la sala de juegos de un joven Kermit the Frog, Piggy, Fozzie Bear, Gonzo, Animal y la nueva Muppet Baby, Summer Penguin. La serie contará con apariciones especiales de Muppets favoritos de los fans, incluyendo: Statler y Waldorf, Bunsen y Beaker, Rowlf the Dog, Rizzo y Dr. Teeth.