Phineas y Ferb son Phineas Flynn y su hermanastro, Ferb Fletcher, quienes están decididos a hacer que cada día de sus vacaciones de verano sea divertido. Intentan construir una montaña rusa a gran escala, convertirse en músicos, crear una playa en el patio trasero y viajar en el tiempo para conocer dinosaurios. Su mascota familiar, Perry el Ornitorrinco, también es un agente secreto y lucha contra el mal. Mientras tanto, la hermana mayor, Candace, los delata ante Mamá y Papá, aunque nunca parece poder atraparlos en el acto.