Hace mucho tiempo, una niña llamada Haruka Haruno sueña con convertirse en una princesa como las de los cuentos de hadas. Sin embargo, sus compañeros de guardería siempre la acosan debido a su sueño. Más tarde conoció a un chico llamado Kanata, quien le dio un extraño amuleto mientras le pedía que nunca renunciara a sus sueños. Unos años después, ahora con 13 años, Haruka asiste a la academia interna Noble Academy, todavía atesorando sus sueños de convertirse en una princesa como las de sus libros ilustrados. Un día, se encontró con dos criaturas de hadas del Reino de la Esperanza: Pafu y Aroma, quienes eran seguidas por un hombre extraño llamado Close. Las hadas le dijeron que él trabaja para Dys Dark, liderado por una bruja llamada Dyspear, quien quiere traer desesperación al mundo encerrando los sueños en la Puerta de la Desesperación. Sin tener otra opción, el amuleto que tenía resultó ser una llave y las hadas le dieron un Perfume de Princesa, convirtiéndose en una de las guerreras elegidas del Reino de la Esperanza: Cure Flora, una Pretty Cure para oponerse a...