Counterpart trata sobre un mundo misterioso oculto bajo la superficie de nuestra existencia cotidiana. Howard Silk es un humilde engranaje en la maquinaria burocrática de una agencia de espionaje de las Naciones Unidas con sede en Berlín. Cuando Howard descubre que su organización protege el secreto de un cruce hacia una dimensión paralela, se ve empujado a un mundo sombrío de intriga, peligro y traición... donde el único hombre en quien puede confiar es su contraparte casi idéntica de este mundo paralelo. La serie explora temas de identidad, destino y amor perdido, planteando la eterna pregunta: "¿qué pasaría si nuestras vidas pudieran haber sido diferentes?"