Im Jahr 2199 angesiedelt, handelt Pandora von einer einfallsreichen jungen Frau, die alles verloren hat, aber im Space Training Academy der Erde ein neues Leben findet, wo sie und ihre Freunde lernen, die Galaxie vor außerirdischen und menschlichen Bedrohungen zu verteidigen. Als Geheimnisse über ihre eigene Identität ans Licht kommen, muss sie die Wahrheit aufdecken und herausfinden, ob sie die Retterin der Menschheit oder das Werkzeug ihrer Zerstörung sein wird.