Hyde & Seek spielt in einer Welt, in der jeder etwas zu verbergen hat und niemand ist, wer er zu sein scheint. Bei der Untersuchung eines Mordes decken Polizei und Einwanderungsbehörden ein Netzwerk potenzieller Terroristen auf, die unter falschen Pässen nach Australien eingereist sind. Die Feinde der nationalen Sicherheit verstecken sich nun offen und die Jagd hat begonnen, sie zu fassen, bevor die nächste Gräueltat geschieht.