Cleaners folgt zwei atemberaubenden jungen Frauen, die sich als ein Team von hochqualifizierten und tödlichen Auftragskillern entpuppen. In der ersten Staffel geht ein Auftrag für ihren Chef schief und das Duo findet sich schnell als Ziel des Klienten ihres Chefs, dem FBI – und sogar ihres eigenen Chefs – wieder, dessen Team von Assassinen nun darauf aus ist, sie zu eliminieren. Staffel 2 beginnt auf einer Karibikinsel zwei Wochen nach dem Ende der ersten Staffel. Veronica und Roxie erkennen, dass sie ihrer Vergangenheit noch nicht entkommen sind... Die weiblichen Assassinen versuchen, ein großes Drogenkartell zu Fall zu bringen und sind in die Machenschaften von Mother verwickelt, die versucht, sie zu jagen. Währenddessen ist Agent Barnes auf einer Mission, um Mother zu Fall zu bringen.