تتبع "النهر" قصة خبير الحياة البرية وشخصية التلفزيون إيميت كول. انطلق إيميت في رحلة حول العالم مع زوجته تيس وابنه لينكولن، أثناء تصوير ما سيصبح واحدًا من أكثر البرامج شعبية على التلفزيون. بعد أن اختفى في عمق الأمازون، انطلقت عائلته وأصدقاؤه وطاقمه في رحلة غامضة وميتة للعثور عليه. ذهب المستكشف الشهير الدكتور إيميت كول بحثًا عن السحر في أعماق الأمازون غير المستكشفة ولم يعد أبدًا. الحقيقة الصادمة حول اختفائه موجودة هناك، في مكان ما، تنتظر فقط أن تُكتشف. بالنسبة للملايين من الأطفال الذين نشأوا وهم يشاهدون برنامجه عن الطبيعة، كان الدكتور كول بطلًا. أما بالنسبة لابنه لينكولن، فقد كان أكثر من مجرد لغز. الآن، بعد ستة أشهر من اختفائه، أصبح لينكولن أخيرًا مستعدًا لدفن الماضي عندما ينطلق جهاز الطوارئ الخاص بالدكتور كول فجأة. بناءً على إلحاح والدته، تيس، ينضم لينكولن على مضض إليها في البحث عن والده. لتمويل عملية الإنقاذ، يوافقون على السماح للمنتج السابق المراوغ للدكتور كول، كلارك، بتصوير المهمة بأسلوب وثائقي.