في عام 2016، يتسبب انهيار محطة طاقة نووية في تلوث طوكيو، مما يجبر الحكومة على إصدار أمر لمواطنيها بالإخلاء. بعد 20 عامًا، أصبحت طوكيو مدينة أشباح بسبب المستويات العالية من الإشعاع التي حظرت الحكومة دخول أي شخص إليها. عندما يتم استقبال إشارة استغاثة من المنطقة، ترسل قوة الدفاع الذاتي البرية اليابانية ثلاث فتيات من الوحدة الخاصة "كوبيليون" للبحث عن ناجين في العاصمة المدمرة.