1686 yılında geçen "Minyatürcü", 18 yaşındaki Nella Oortman'ın Amsterdam'ın en zengin semtindeki görkemli bir evin kapısını çalmasıyla başlar. Umut ve hayallerle dolu olarak, zengin tüccar Johannes Brandt'ın eşi olarak yeni bir hayata başlamak için köyünden gelmiştir. Ancak onu soğuk tavırlı kız kardeşi Marin ve hizmetçileri karşılar ve kısa sürede hiçbir şeyin göründüğü gibi olmadığını fark eder. Brandt nihayet göründüğünde, ona olağanüstü bir düğün hediyesi sunar: evlerinin minyatür bir kopyası olan ve gizemli bir Minyatürcü tarafından döşenmesi gereken bir dolap. Bu minyatürlerin küçük yaratımları, evin içinde olup bitenleri beklenmedik şekillerde yansıtır ve Nella kısa sürede hepsini bekleyen tehlikelerin arttığını fark eder.