Претња Матрикс је једночасовна драма о високо специјализованом, елитном тиму за брзо реаговање, створеном да одговори на извештај Претња Матрикс, документ који се сваког јутра представља председнику, а који идентификује највеће тренутне претње по безбедност САД. Мисија тима је да чува земљу од међународних и домаћих претњи, користећи своју комбиновану стручност и најсавременију технологију како би им помогли у борби против многих облика терора и непријатеља одлучних да униште наш начин живота. Водећи публику иза насловних страна и у свет безбедности домовине, Претња Матрикс драматизује шта радимо у свету безбедности домовине, зашто то радимо и да ли то функционише. Вођа ове јединице је специјални агент Џон Килмер. Овај бивши агент ФБИ има овлашћење Беле куће да користи техничке вештине, ватрену моћ и специјализоване агенте ФБИ, ЦИА и НСА, између осталих. Килмер извештава пуковнику Роџеру Аткинсу, везисту за операције председника. Килмерова бивша жена, специјални агент Френки Елрој-Килмер, високо је обучени стручњак за испитивање и 'профилатор' чије вештине јој омогућавају да сломи најтврдоглавије непријатеље. Остатак Килмеровог тима чине Мо, бивши оперативни агент ЦИА египатско-америчког порекла; Лиа "Ларк" Ларкин, бивши специјалиста ФБИ за форензику; Тим Серано, агент ДЕА из Мајамија; и Џелани, афроамерички компјутерски геније који пресреће телефонске, факс и радио сигнале из целог света и