Leo, Donnie, Raph i Mikey su mutirane kornjače koje je u veštini ninjutsua obučavao njihov miš učitelj, Majstor Splinter. Izašavši iz svog kanalizacionog skrovišta, braća reptili se suočavaju sa čudesnim svetom Njujorka, suočavajući se sa zlikovcima opasnijim i pizzama ukusnijim nego što su mogli da zamisle. Kroz borbe sa Šrederom, Kraangom i mnoštvom supermoćnih mutanata, Kornjače uče da se oslanjaju na sebe i jedni na druge dok odrastaju u heroje koje su predodređeni da postanu.