Godina je 2015, a polovina svetske populacije je mrtva, žrtve katastrofe poznate kao Drugi udar! Odgovarajući na poziv svog tajanstvenog oca, 14-godišnji Šinji Ikari stiže u obnovljeni grad Novi Tokio-3 upravo kada napada ogroman stvor koji se identifikuje kao "Anđeo"! Prisiljen da uđe u kokpit gigantske bio-mehaničke konstrukcije poznate kao Evangelion, Šinji mora da brani grad od besnog Anđela ili da umre pokušavajući!