Glavna Motoko Kusanagi je prelepa, ali smrtonosna kiborg koja je vođa tima Sekcije 9 - tajne jedinice japanske vlade zadužene za borbu protiv terorizma i sajber rata. Okružena timom vrhunski obučenih stručnjaka, Motoko se suočava sa svojim najvećim izazovom - Smeškom, teroristom koji je pre mnogo godina organizovao otmicu i iznudu, a sada se iznenada ponovo pojavio. Da bi otkrila identitet ovog enigmatičnog kriminalca, Motoko i Sekcija 9 ulaze u smrtonosni lavirint i moraće da iskoriste svu svoju stručnost kako bi preživeli.