Сюжет Hunter × Hunter сосредоточен на молодом мальчике по имени Гон Фрикс, который однажды обнаруживает, что его отец, о котором ему всегда говорили, что он мертв, на самом деле жив и здоров. Он узнает, что его отец, Гинг Фрикс, является легендарным Охотником — человеком, который доказал свою исключительность на экзамене и стал элитным членом человечества, обладающим лицензией на путешествия куда угодно и на выполнение любых действий. Несмотря на то, что его отец оставил Гона с родственниками, чтобы следовать за своими мечтами, Гон решает идти по стопам отца, сдать экзамен на Охотника и в конечном итоге найти своего отца, чтобы доказать свою ценность как Охотника.