Star Trek: Lower Decks foca na tripulação de apoio que serve em uma das naves menos importantes da Frota Estelar, a U.S.S. Cerritos, em 2380. Os cadetes Mariner, Boimler, Rutherford e Tendi precisam dar conta de seus deveres e de suas vidas sociais, muitas vezes enquanto a nave é abalada por uma infinidade de anomalias de ficção científica.