Quando o pai de Kaito Kuroba morre em circunstâncias misteriosas, ele descobre a identidade secreta do pai: um famoso criminoso internacional conhecido como o Ladrão Fantasma 1412, e que ele foi assassinado por uma organização misteriosa por se recusar a ajudá-los a recuperar a "Joia Pandora" – uma joia que concede imortalidade. Ele jura impedir que a organização obtenha a joia e assume a identidade do pai. Kaito pesquisa e rouba joias famosas e inestimáveis com histórias interessantes de locais incrivelmente bem defendidos, mas sempre as devolve após a próxima lua cheia.