O cenário do anime é uma cidade fictícia japonesa chamada Sugomori City. Um dia, Noriko Sonosaki diz ao seu colega de classe Katsuhira Agata: "Você foi selecionado para ser um Kiznaiver." O Kizuna System, que permite a Katsuhira compartilhar suas feridas, o conecta a colegas de classe cujas vidas e personalidades são completamente diferentes das dele. O Kizuna System é um sistema incompleto para a implementação da paz mundial que conecta pessoas através de feridas. Todos aqueles que estão conectados a este sistema são chamados de Kiznaivers. Quando um Kiznaiver é ferido, o sistema divide e transmite a ferida entre os outros Kiznaivers. Sugomori City é construída em terra recuperada, mas com o passar dos anos, a população da cidade está diminuindo. A história se passa nesta cidade onde Katsuhira e os outros vivem.