Leo, Donnie, Raph i Mikey to mutanty-tortusy, które zostały przeszkolone w sztuce ninjutsu przez swojego szczurzego mistrza, Mistrza Splintera. Wychodząc ze swojej kanalizacyjnej kryjówki, bracia gady stają w obliczu cudownego świata Nowego Jorku, stawiając czoła złoczyńcom bardziej niebezpiecznym i pizzy smaczniejszej niż cokolwiek, co mogli sobie wyobrazić. W trakcie walk z Shredderem, Kraangiem i mnóstwem superpotężnych mutantów, Turtusy uczą się polegać na sobie i na sobie nawzajem, dorastając do roli bohaterów, którymi są przeznaczeni być.