Przepiękna, niezrównana przewodnicząca samorządu uczniowskiego, Medaka Kurokami, rozwiązuje problemy wszystkich! Medaka Kurokami, która właśnie została 98. przewodniczącą samorządu uczniowskiego w Akademii Sandbox, zgodnie z obietnicą wyborczą, ustawia skrzynkę na sugestie. "Twoje marzenia należą do ciebie. Dąż do nich i spełniaj je samodzielnie. Twoje zmartwienia jednak należą do mnie. Prześlij je wszystkie do mnie!!" Gdy Medaka rozwiązuje problemy swoich koleżanek i kolegów z klasy wraz ze swoim przyjacielem z dzieciństwa, Zenkichi Hitoyoshim, jej skrzynka na sugestie, nazwana Medaka Box, zdobywa ogromną popularność wśród uczniów.