Gdy Kaito Kuroba dowiaduje się o tajemniczej śmierci swojego ojca, odkrywa jego sekretną tożsamość: słynnego międzynarodowego złodzieja znanego jako Międzynarodowy Złodziej 1412: Fantomowy Złodziej. Dowiaduje się również, że jego ojciec został zamordowany przez tajemniczą organizację za odmowę pomocy w odzyskaniu "Kamienia Pandory" – klejnotu dającego nieśmiertelność. Kaito przysięga powstrzymać organizację przed zdobyciem kamienia i przyjmuje tożsamość ojca. Kaito bada i kradnie słynne, bezcenne klejnoty o ciekawych historiach z niezwykle strzeżonych miejsc, ale zawsze zwraca je po następnej pełni księżyca.