Akcja anime rozgrywa się w fikcyjnym japońskim mieście Sugomori. Pewnego dnia Noriko Sonosaki mówi swojemu koledze z klasy, Katsuhirze Agacie: „Zostałeś wybrany na Kiznaivera”. System Kizuna, który pozwala Katsuhirze dzielić się swoimi ranami, łączy go z kolegami z klasy, których życie i osobowości całkowicie różnią się od jego. System Kizuna to niedoskonały system wdrażania pokoju na świecie, który łączy ludzi poprzez rany. Wszyscy, którzy są podłączeni do tego systemu, nazywani są Kiznaiverami. Kiedy jeden Kiznaiver zostaje zraniony, system dzieli i przekazuje ranę pozostałym Kiznaiverom. Miasto Sugomori zostało zbudowane na terenach odzyskanych, ale z biegiem lat populacja miasta spada. Historia rozgrywa się w tym mieście, w którym mieszkają Katsuhira i pozostali.