Invader ZIM to ekscentryczny żołnierz obcego z planety Irk. Został wygnany z Imperium Irkenów po tym, jak niemal zniszczył swoją rodzinną planetę podczas wczesnej misji. Po błaganiu swoich przełożonych, Wszechmogących Najwyższych Czerwonego i Fioletowego, o drugą szansę, postanawiają pozbyć się go raz na zawsze. Wciągają go w "tajną misję" na mało znaną planetę na skraju wszechświata, planetę o mało prawdopodobnej nazwie Ziemia, mając nadzieję, że zginie po drodze. Jednak ich podstęp obraca się przeciwko nim, gdy ZIM bezpiecznie dociera na Ziemię i zaczyna swoją subtelną podbój. Przebiera się za ucznia, a jedyną osobą, która może go powstrzymać, jest jeden chłopak - Dib, nieco szalony badacz zjawisk paranormalnych, który przenika przez przebranie ZIM-a i ma zamiar zakończyć jego "terror". Jedynym problemem jest to, że żaden z nich nie jest zbyt dobry w powstrzymywaniu drugiego.