"미션 T"는 세계의 파멸을 막기 위한 스파이와 비밀 정보 기관들의 그림자 전쟁입니다. 어릴 때부터 닌자로 훈련받아 재능 있는 스파이로 성장한 네고로 보탄의 이야기입니다. 그녀는 연기력이 뛰어난 스파이 쿠루마와 함께, 천재 세르비아계 미국인 발명가 니콜라 테슬라의 "유산"인 "테슬라 크리스탈"을 회수하는, 세계가 걸린 새로운 임무에 나섭니다. 하지만 다른 나라들과 그들의 요원들이 이미 테슬라 크리스탈을 확보하기 위해 움직이고 있으며, 보탄과 쿠루마는 그들을 능가하기 위해 모든 지혜를 짜내야 할 것입니다.