레오, 도니, 래프, 그리고 마이키는 쥐 스승인 스플린터 마스터에게 닌자술을 배운 돌연변이 거북이들입니다. 그들은 하수구 은신처를 떠나 뉴욕시의 경이로운 세계에 맞서며, 상상할 수 있는 것보다 더 위험한 악당들과 더 맛있는 피자에 직면하게 됩니다. 셰레더, 크랑, 그리고 수많은 초강력 돌연변이들과의 전투를 통해 거북이들은 스스로와 서로에게 의지하는 법을 배우며, 그들이 운명적으로 되어야 할 영웅으로 성장해 나갑니다.