닥터 라이트라는 천재 과학자가 만든 로봇. 그는 자신의 수많은 창조물들이 오직 선한 목적으로만 사용되기를 바랐다. 하지만 어느 날, 닥터 와일리라는 광기 어린 과학자가 라이트의 오리지널 로봇 6대와 설계도를 훔쳤다. 그는 그것들을 이용해 새로운 로봇 시리즈를 만들기 시작했고, 그들의 목표는 단 하나... 세계 정복! 하지만 닥터 라이트는 메가맨을 만들 때 궁극의 비장의 무기를 부여했다. 메가맨은 다른 로봇들의 능력을 흡수하는 능력을 가지고 있다. 이제 메가맨과 그의 절친한 친구인 로봇 개 러시는 사악한 닥터 와일리로부터 영원한 평화를 위해 싸운다!