지구는 다른 차원의 외계 종족 '노바'의 침공을 받아 전쟁 중인 약간 미래적인 세계. 이야기는 외계인과 싸우기 위해 유전적으로 개조된 소녀들, '판도라'와 그녀들의 파트너인 '리미터'가 펼치는 특별한 훈련 학교에 입학한 일본 소년 '아오이 카즈야'의 모험을 따라간다. 리미터는 '프리징'이라는 특수 능력을 사용하여 상대방의 움직임을 봉쇄한다. 주인공은 반에서 가장 강력한 판도라로 보이는 특이한 연상의 소녀 '브리짓 르네 사테라이저'를 만나게 되지만, 그녀는 아직 자신의 리미터를 선택하지 않은 상태다. 친구들의 만류에도 불구하고, 그는 그녀의 리미터가 되기로 결심한다.