2009년 시부야를 배경으로 하는 《CHAOS;HEAD》의 이야기는 사립 스이메이 학원의 고등학생인 니죠 타쿠미와 최근 시부야 지역에서 발생한 '신세대 광기'라 불리는 기괴하고 잔혹한 살인 사건들을 중심으로 전개됩니다. 이야기는 9월 28일, 타쿠미가 온라인 친구인 그림과 대화하는 장면으로 시작됩니다. 타쿠미는 지역 뉴스나 국제 뉴스에 관심이 없기 때문에, 그림은 최근 신세대 사건들에 대해 타쿠미에게 정보를 전달하려 합니다. 그림과 타쿠미의 대화 도중에 쇼군이라는 인물이 채팅방에 참여합니다. 그림이 채팅방을 나가자 쇼군이 말을 시작합니다. 그는 매우 모호하고 혼란스러운 방식으로 말하며 타쿠미를 불안하게 만듭니다. 그러고는 타쿠미에게 수많은 이미지 링크를 보내는데, 그중 하나는 남자가 벽에 말뚝으로 박혀 잔혹하게 살해당하는 모습처럼 보입니다.