「ザ・アサシン」は、ヴィクターという名でしか知られない冷酷な暗殺者を中心に描かれる。匿名の依頼主に裏切られた彼は、執拗なCIA捜査官や、同じく死と隣り合わせの殺し屋など、世界中から複数の敵に追われる身となる。生き延びるため、ヴィクターは裏切り者の正体を暴かなければならない。同時に、彼の中に蘇り始めた人間性の微かな輝きとも格闘することになる。それは、彼の生存にとって最大の脅威となるかもしれない。