『ストライクウィッチーズ』は、第二次世界大戦の歴史が我々の知るものとは大きく異なる、もう一つの1944年を舞台にした物語です。1939年、ネウロイと呼ばれる異星の侵略者が地球に現れました。ネウロイは今回が初めてではなく、人類の歴史上、不規則な間隔で出現してきたのです。ネウロイは主に航空機で人類を攻撃しますが、その母艦は致死性の瘴気を放つことができます。この瘴気は人間にとって致命的な毒であり、影響を受けた地域の住民は家を追われることを余儀なくされます。ネウロイはその後、汚染された地域から地球の天然資源を略奪し、人類に対抗するために利用します。幸いなことに、瘴気は海を越えて拡散しないため、海はネウロイに対する人類の主要な防衛線となっています。瘴気の中では普通の人間は戦うことができないため、魔女たちがネウロイに対する軍事防衛の最前線となっています。各魔女は、瘴気を遮断するだけでなく、物理的な攻撃からも身を守る防御フィールドを展開することができます。脚部に装着されたストライカーユニットを用いて空を飛び、戦闘に参加する魔女たちは、普通の人間には大きすぎて扱いきれないような強力な武器を魔法の力で振るいます。このシリーズは、ネウロイからブリテン諸島を守るために最前線で戦う第501統合戦闘航空団の戦いを追います。人類は地球を取り戻し、故郷に平和をもたらすことができるのでしょうか？『ストライクウィッチーズ』で確かめよう！