「ピュア」は、新しく選ばれたメノナイト教会の牧師ノア・ファンクの物語。彼は、仲間のメノナイトを警察に密告することで、コミュニティから麻薬密売人を排除しようと決意する。しかし、問題を解決するどころか、ノアの行動はメノナイト・マフィアのリーダー、イーライ・ヴォスから最後通牒を引き起こす。家族を守るため、彼は違法な事業に関わらなければならなくなるのだ。ノアは、マフィアのために働くことになったなら、組織を壊滅させるのに十分な証拠を秘密裏に集めようと決める。 人々の目に触れないところで、オールド・オーダー・メノナイトは独自の生活を送っている。彼らは祖先と同じ質素な生活様式に献身している。しかし、アウトロー・メノナイトのほんの一握りが、北米で最も効率的な麻薬密売組織の一つを支配している。フアレス・カルテルとの不浄な同盟によって供給され、そのパイプラインはメキシコからアメリカ合衆国を通り、カナダへと延びている。 ノアは、その信念と原則が、あらゆる段階で試されることになる。魂を救い、使命を達成するために奮闘するノアは、意外な人物から助けを得る。それは、高校時代のライバルであり、地元の警官であるブロンコ・ノヴァクだった。法執行官としてのキャリアが風前の灯火であるブロンコは、メノナイト・マフィアの事件を再起への切符と見なしていた。