クォンタム航空66便は、乗客247名を乗せ、ドイツのフランクフルトからニューヨークのJFK国際空港に向けて離陸したばかり。離陸後、終末ウイルスの感染者が意識を失い、客室乗務員と医師が救助を試みる。パイロットは飛行機を着陸させようとするが、地上にいる人々がウイルスの存在を知っているため、それは不可能だった。大使とその秘書は、政府による66便撃墜の秘密の試みに立ち向かうパイロットを助ける。そして、もし飛行機が着陸した場合、地球に終末が到来する。