Leo, Donnie, Raph e Mikey sono tartarughe mutanti che sono state addestrate nell'arte del ninjutsu dal loro maestro ratto, Master Splinter. Emerse dal loro rifugio sotterraneo, i fratelli rettili affrontano il meraviglioso mondo di New York City, affrontando villain più pericolosi e pizze più deliziose di quanto avessero mai potuto immaginare. Attraverso battaglie con Shredder, i Kraang e una miriade di mutanti super potenti, le Tartarughe imparano a fare affidamento su se stesse e l'uno sull'altro mentre crescono per diventare gli eroi che sono destinati a essere.