Ambientata nell'anno 2199, Pandora racconta la storia di una giovane donna piena di risorse che ha perso tutto, ma che trova una nuova vita all'Accademia di Addestramento Spaziale della Terra, dove lei e i suoi amici imparano a difendere la galassia da minacce, sia aliene che umane. Quando iniziano a emergere segreti sulla natura della sua stessa identità, dovrà scoprire la verità e se sarà la salvatrice dell'umanità o lo strumento della sua distruzione.