Kudo Shinichi è un diciassettenne detective liceale che la gente chiama il "Sherlock Holmes dei tempi moderni". Tuttavia, una notte, dopo un appuntamento con la sua amica d'infanzia, Ran, Shinichi assiste a uno scambio illegale e, colto di sorpresa, viene stordito e drogato con una sostanza che avrebbe dovuto ucciderlo... ma si sveglia e si ritrova rimpicciolito a sette anni. Per rintracciare gli uomini che gli hanno fatto questo, Shinichi nasconde la sua identità e vive con Ran, il cui padre è un detective senza speranza, e con ciò arrivano una serie di omicidi e misteri che deve risolvere.