WondLa berpusat pada Eva, seorang remaja yang penasaran, antusias, dan bersemangat yang dibesarkan di bunker bawah tanah canggih oleh Muthr, seorang robot pengasuh. Pada ulang tahunnya yang ke-16, serangan terhadap bunker Eva memaksanya ke permukaan Bumi, yang kini dihuni oleh alien dan ditutupi fauna dunia lain, dan tidak ada manusia lain yang ditemukan. Faktanya, Bumi tidak lagi disebut Bumi, melainkan Orbona. Otto, seekor tardigrada raksasa yang menggemaskan yang memiliki kekuatan telepati dengan Eva, dan Rovender, seorang alien pemarah dengan masa lalu yang kelam, bergabung dengan Eva saat ia memimpin tim dalam pencarian berbahaya untuk menemukan manusia, rumahnya, dan takdir sejatinya.