Kisah ini mengikuti mahasiswa Tadayasu Sawaki (diperankan oleh Nakamura Yuichi), putra kedua seorang pembuat miso. Ia masuk Universitas Pertanian di Tokyo dan segera mengetahui bahwa ia dapat melihat mikroorganisme yang muncul di hadapannya sebagai karakter-karakter aneh. Tidak hanya itu, ia juga bisa berkomunikasi dengan bakteri di sekitarnya.