Lavender Castle adalah tempat misteri dan legenda, masyhur di seluruh alam semesta, sebuah kota terapung penuh cahaya, tempat kedamaian, harmoni, dan segala impian yang pernah ada. Ia adalah pusat alam semesta dan sumber kekuatan terbesar – jika ia hancur, alam semesta akan terjerumus dalam kegelapan selamanya. Ilmuwan jahat Dr. Agon berencana melakukan hal tersebut. Seorang narsisis kesepian dengan kekuatan transmutasi yang dibantu teknologi, ia mendambakan kegelapan dan bertekad menghancurkan Lavender Castle dari kapal luar angkasa bentengnya, Dark Station, kekuatan penghancur paling dahsyat di alam semesta, diawaki oleh budak tak terlihat yang bekerja jauh di dalam perutnya. Untuk mencegah hal ini, Kapten Thrice telah memulai misi untuk menemukan Lavender Castle yang sulit dipahami sebelum Dr. Agon. Pertemuan sebelumnya dengan Lavender Castle telah menghidupkan tongkat jalan Thrice dan meninggalkan Kapten dengan pengetahuan khusus tentang kekuatan dan kemampuannya.