Le premier souvenir de Yuki remonte à une nuit d'hiver orageuse, où elle fut attaquée par un vampire... Puis sauvée par un autre. Dix ans plus tard, Yuki Cross, la fille adoptive du directeur de l'Académie Cross, Kaien Cross, a grandi et est devenue une gardienne de la race vampirique, protégeant son amour d'enfance, Kaname, de toute découverte alors qu'il dirige un groupe de vampires dans cet internat d'élite. Mais à ses côtés se trouve aussi Zero Kiryu, un ami d'enfance dont la haine pour les créatures qui ont détruit tout ce qui lui était cher le laisse déterminé à ne jamais leur faire confiance. Cet arrangement de coexistence semble parfait, mais les vampires ont-ils vraiment renoncé à leurs penchants meurtriers, ou y a-t-il une vérité plus sombre derrière leurs actions ? Car dans ce monde de secrets, rien n'est ce qu'il paraît. Et le prix d'une confiance mal placée pourrait être pire que la mort.